"Psychonauts 2" ist ein Single-Player Action- Adventure. Es geht um den 10-jährigen Razputin "Raz" Aquato, der ein "Psychonaut" werden will. "Psychonauts" sind in dieser Welt Geheimagenten/innen, die übernatürliche Fähigkeiten besitzen. Unter anderem können sie in den Geist anderer Spielcharaktere eindringen, um dort verborgene Erinnerungen wiederzufinden, Ängste zu bekämpfen und traumatische Erlebnisse zu bewältigen oder die Gedanken, Vorstellungen, Wünsche der Personen zu beeinflussen. Im Laufe der Geschichte stellt sich heraus, dass die "Psychonauts" infiltriert wurden. Raz muss mit Hilfe von Freunden und Freundinnen und anderen Agenten und Agentinnen herausfinden, wer die "Psychonauts" infiltriert hat. Auf seiner Reise lernt er viel über sich selbst, was es heißt ein "Psychonaut" zu sein und welche Verantwortung es mit sich bringt, wenn man die Psyche anderer Menschen verändern kann. Die einzelnen Levels des Spiels stellen die psychischen Welten der Charaktere dar. Diese sind verbunden durch eine Spielwelt, die frei erkundet werden kann. Fähigkeiten werden eingesetzt, um Gegner zu besiegen, Informationen zu sammeln oder Jump´n´run-Passagen zu meistern.